截至2016年12月19日，全国股转系统挂牌公司数量达10,000家，总股本5698亿股，总市值约3.87万亿元。2013年全国股转系统揭牌运营以来，共有3784家挂牌公司完成5659次股票发行，融资2525.84亿元，平均单次发行融资4463.40万元。其中，2016年以来挂牌公司完成2705次股票发行，融资1167.56亿元，平均单次发行融资4316.29万元。从融资用途来看，除补充流动资金、提供做市库存股、股权激励等用途外，多数为经营性融资。今年以来，用于项目融资、研发、对外投资等经营性融资的发行次数占比达82%。挂牌公司累计披露重大资产重组和收购537次，合计交易金额884.41亿元；其中2016年以来挂牌公司披露并购重组308次，交易金额523.65亿元。
挂牌公司以中小微企业为主，科技创新、研发驱动、成长性好等特征突出。目前，10,000家挂牌公司中中小微企业合计占94.61%，平均成立年限9.85年。挂牌公司中高新技术企业占比65%，先进制造业、现代服务业占比合计72%，战略新兴产业占比25%。挂牌公司平均研发投入强度为5.63%，较全社会研发强度高出3.53个百分点。截至2016年三季度末，有4273家挂牌公司拥有有效专利合计12.39万件。2014年、2015年、2016年上半年，挂牌公司（剔除金融业）平均营业收入同比分别增长10.86%、17.33%、18.39%，平均净利润同比分别增长23.55%、34.61%、21.44%，盈利覆盖面稳定在75%-85%之间。
目前，挂牌公司已实现省市、行业全覆盖。其中东部10省合计7285家，占比72.85%；中部6省共1365家，占比13.65%；西部12省共983家，占比9.83%；东北3省共367家，占比3.67%。民族地区挂牌公司407家；贫困地区挂牌公司182家。行业方面，覆盖所有89个非综合类大类行业，其中软件和信息技术服务业、商务服务业、互联网和相关服务以及专业技术服务业等新业态挂牌公司比重相对较高。